与传统诊断方法相比，牛用B超机具有省时、安全、损伤小、操作简便、准确率高等优点、早在20世纪80年代，就己被用于兽医临床早期的妊娠诊断。随后，在家畜的生殖道生理性和病理性结构的诊断中也得到了普遍的应用。
牛用B超机宫检查:通过牛用B超机检查子宫是否开张以及子宫腔内的状态，根据牛用B超机声像图成像观察子宫有无炎症，因为有些卵巢囊肿的奶牛可能会伴发子宫炎，但针对奶牛卵巢囊肿的诊断来说意义不大。
    牛用B超机卵巢检查:卵泡正常发育时直径在1厘米左右，排卵时增大到2.0-2.5厘米;通过牛用B超机探查，卵巢囊肿奶牛的囊肿卵泡直径会增大到3-4厘米，甚至增大到6厘米。可通过扫查到的牛用B超机声像图测量卵泡状结构直径和卵泡壁的厚度进行鉴别诊断。

    牛用B超机的最小分辨力为0.2厘米，一般牛用B超机可以探查到直径，为0.2 -0.3厘米的卵泡，牛用B超机对1-1.5厘米卵泡的检出率为92%，而直肠检查检出率只有62%;牛用B超机对直径超过15毫米的卵泡检出率为100%另有报道,牛用B超机对黄体囊肿诊断的准确性较高，通常二者之间鉴别诊断准确率在85%左右。牛用B超机作为临床检查的一种辅助检查手段，可提高鉴别卵巢囊肿的准确率。但是，在实际临床操作中由于操作熟练程度不同，有时很难做出准确判断，此时可通过测定血浆中孕酮等激素水平来确定卵泡黄体化程度，进而增加对卵巢囊肿鉴别诊断的准确性。